Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC175P0C221 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC175P0C221 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms