Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CSF1RP07333 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms