Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDN1P05305 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDN1P05305 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDN1P05305 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDN1P05305 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDN1P05305 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EDN1P05305 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EDN1P05305 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EDN1P05305 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EDN1P05305 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDN1P05305 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDN1P05305 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDN1P05305 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EDN1P05305 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EDN1P05305 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EDN1P05305 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EDN1P05305 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EDN1P05305 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EDN1P05305 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EDN1P05305 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EDN1P05305 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EDN1P05305 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDN1P05305 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDN1P05305 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDN1P05305 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDN1P05305 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDN1P05305 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EDN1P05305 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDN1P05305 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDN1P05305 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDN1P05305 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDN1P05305 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDN1P05305 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDN1P05305 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDN1P05305 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDN1P05305 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDN1P05305 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDN1P05305 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EDN1P05305 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDN1P05305 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDN1P05305 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDN1P05305 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDN1P05305 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDN1P05305 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDN1P05305 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDN1P05305 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDN1P05305 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDN1P05305 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDN1P05305 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDN1P05305 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDN1P05305 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDN1P05305 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDN1P05305 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDN1P05305 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDN1P05305 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDN1P05305 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDN1P05305 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDN1P05305 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDN1P05305 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EDN1P05305 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDN1P05305 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDN1P05305 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDN1P05305 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDN1P05305 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDN1P05305 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDN1P05305 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDN1P05305 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDN1P05305 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDN1P05305 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDN1P05305 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EDN1P05305 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDN1P05305 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDN1P05305 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDN1P05305 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDN1P05305 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDN1P05305 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDN1P05305 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDN1P05305 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDN1P05305 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDN1P05305 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EDN1P05305 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDN1P05305 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDN1P05305 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDN1P05305 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EDN1P05305 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDN1P05305 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDN1P05305 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDN1P05305 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EDN1P05305 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDN1P05305 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDN1P05305 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDN1P05305 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDN1P05305 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDN1P05305 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDN1P05305 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDN1P05305 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDN1P05305 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDN1P05305 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDN1P05305 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDN1P05305 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms