Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MBD4O95243 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MBD4O95243 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MBD4O95243 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MBD4O95243 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MBD4O95243 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MBD4O95243 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MBD4O95243 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MBD4O95243 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MBD4O95243 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MBD4O95243 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MBD4O95243 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MBD4O95243 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MBD4O95243 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MBD4O95243 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MBD4O95243 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MBD4O95243 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MBD4O95243 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MBD4O95243 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MBD4O95243 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MBD4O95243 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MBD4O95243 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MBD4O95243 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MBD4O95243 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MBD4O95243 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MBD4O95243 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MBD4O95243 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MBD4O95243 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MBD4O95243 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MBD4O95243 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MBD4O95243 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MBD4O95243 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MBD4O95243 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MBD4O95243 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MBD4O95243 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MBD4O95243 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MBD4O95243 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MBD4O95243 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MBD4O95243 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MBD4O95243 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MBD4O95243 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MBD4O95243 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MBD4O95243 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MBD4O95243 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MBD4O95243 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MBD4O95243 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MBD4O95243 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MBD4O95243 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MBD4O95243 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MBD4O95243 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MBD4O95243 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MBD4O95243 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MBD4O95243 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MBD4O95243 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MBD4O95243 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MBD4O95243 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MBD4O95243 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MBD4O95243 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MBD4O95243 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MBD4O95243 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MBD4O95243 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MBD4O95243 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MBD4O95243 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MBD4O95243 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MBD4O95243 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MBD4O95243 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MBD4O95243 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MBD4O95243 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MBD4O95243 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MBD4O95243 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MBD4O95243 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MBD4O95243 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MBD4O95243 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MBD4O95243 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MBD4O95243 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MBD4O95243 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MBD4O95243 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MBD4O95243 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MBD4O95243 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MBD4O95243 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MBD4O95243 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MBD4O95243 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MBD4O95243 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MBD4O95243 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MBD4O95243 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MBD4O95243 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MBD4O95243 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MBD4O95243 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MBD4O95243 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MBD4O95243 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MBD4O95243 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MBD4O95243 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MBD4O95243 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MBD4O95243 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MBD4O95243 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MBD4O95243 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MBD4O95243 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MBD4O95243 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MBD4O95243 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MBD4O95243 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms