Protein–RNA interactions for Protein: O60304

ZNF500, Zinc finger protein 500, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF500O60304 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF500O60304 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms