Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB3O43889 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB3O43889 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB3O43889 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB3O43889 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB3O43889 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB3O43889 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB3O43889 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB3O43889 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB3O43889 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB3O43889 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB3O43889 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB3O43889 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB3O43889 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB3O43889 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB3O43889 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB3O43889 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB3O43889 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB3O43889 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB3O43889 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB3O43889 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB3O43889 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB3O43889 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB3O43889 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB3O43889 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB3O43889 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB3O43889 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB3O43889 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB3O43889 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB3O43889 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB3O43889 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB3O43889 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CREB3O43889 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREB3O43889 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREB3O43889 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREB3O43889 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREB3O43889 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREB3O43889 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREB3O43889 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREB3O43889 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREB3O43889 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREB3O43889 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREB3O43889 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREB3O43889 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CREB3O43889 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREB3O43889 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREB3O43889 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREB3O43889 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREB3O43889 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREB3O43889 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREB3O43889 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREB3O43889 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREB3O43889 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREB3O43889 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CREB3O43889 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB3O43889 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB3O43889 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB3O43889 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB3O43889 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB3O43889 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB3O43889 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB3O43889 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB3O43889 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB3O43889 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB3O43889 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB3O43889 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB3O43889 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB3O43889 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB3O43889 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB3O43889 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB3O43889 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB3O43889 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB3O43889 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB3O43889 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB3O43889 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB3O43889 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB3O43889 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB3O43889 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB3O43889 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CREB3O43889 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB3O43889 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB3O43889 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB3O43889 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB3O43889 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB3O43889 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB3O43889 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB3O43889 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB3O43889 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB3O43889 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB3O43889 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB3O43889 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB3O43889 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB3O43889 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB3O43889 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB3O43889 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB3O43889 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB3O43889 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB3O43889 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB3O43889 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CREB3O43889 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.6 ms