Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCO2O43819 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCO2O43819 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCO2O43819 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCO2O43819 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCO2O43819 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCO2O43819 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCO2O43819 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCO2O43819 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCO2O43819 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCO2O43819 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCO2O43819 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCO2O43819 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCO2O43819 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCO2O43819 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCO2O43819 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCO2O43819 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCO2O43819 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCO2O43819 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCO2O43819 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCO2O43819 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCO2O43819 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCO2O43819 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCO2O43819 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCO2O43819 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCO2O43819 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCO2O43819 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCO2O43819 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCO2O43819 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCO2O43819 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCO2O43819 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCO2O43819 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCO2O43819 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCO2O43819 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCO2O43819 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCO2O43819 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCO2O43819 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCO2O43819 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCO2O43819 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCO2O43819 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCO2O43819 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCO2O43819 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCO2O43819 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCO2O43819 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCO2O43819 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCO2O43819 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCO2O43819 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCO2O43819 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCO2O43819 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCO2O43819 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCO2O43819 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCO2O43819 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCO2O43819 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCO2O43819 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCO2O43819 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCO2O43819 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCO2O43819 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SCO2O43819 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCO2O43819 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCO2O43819 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCO2O43819 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCO2O43819 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCO2O43819 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCO2O43819 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCO2O43819 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCO2O43819 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCO2O43819 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCO2O43819 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SCO2O43819 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCO2O43819 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCO2O43819 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCO2O43819 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCO2O43819 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCO2O43819 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCO2O43819 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCO2O43819 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCO2O43819 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCO2O43819 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCO2O43819 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCO2O43819 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCO2O43819 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCO2O43819 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCO2O43819 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCO2O43819 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCO2O43819 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCO2O43819 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCO2O43819 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCO2O43819 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCO2O43819 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCO2O43819 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCO2O43819 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCO2O43819 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCO2O43819 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCO2O43819 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCO2O43819 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCO2O43819 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCO2O43819 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCO2O43819 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SCO2O43819 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCO2O43819 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms