Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATCO43716 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATCO43716 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GATCO43716 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GATCO43716 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATCO43716 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATCO43716 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATCO43716 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATCO43716 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATCO43716 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATCO43716 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATCO43716 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATCO43716 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATCO43716 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATCO43716 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATCO43716 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATCO43716 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATCO43716 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATCO43716 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATCO43716 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATCO43716 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATCO43716 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATCO43716 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATCO43716 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATCO43716 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATCO43716 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATCO43716 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATCO43716 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATCO43716 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATCO43716 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATCO43716 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATCO43716 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATCO43716 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATCO43716 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATCO43716 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATCO43716 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATCO43716 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATCO43716 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATCO43716 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATCO43716 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATCO43716 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GATCO43716 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATCO43716 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATCO43716 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATCO43716 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATCO43716 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATCO43716 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATCO43716 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATCO43716 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATCO43716 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATCO43716 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATCO43716 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATCO43716 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATCO43716 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATCO43716 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATCO43716 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATCO43716 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATCO43716 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATCO43716 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATCO43716 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATCO43716 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATCO43716 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATCO43716 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATCO43716 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATCO43716 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATCO43716 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATCO43716 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATCO43716 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATCO43716 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATCO43716 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATCO43716 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATCO43716 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATCO43716 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATCO43716 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATCO43716 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATCO43716 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATCO43716 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATCO43716 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATCO43716 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATCO43716 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATCO43716 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATCO43716 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATCO43716 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATCO43716 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATCO43716 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATCO43716 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATCO43716 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATCO43716 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATCO43716 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATCO43716 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GATCO43716 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATCO43716 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATCO43716 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATCO43716 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATCO43716 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATCO43716 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATCO43716 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATCO43716 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATCO43716 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GATCO43716 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms