Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

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Length 872 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNQ3O43525 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
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