Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MEFVO15553 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MEFVO15553 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MEFVO15553 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MEFVO15553 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MEFVO15553 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MEFVO15553 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MEFVO15553 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MEFVO15553 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MEFVO15553 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MEFVO15553 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MEFVO15553 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MEFVO15553 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MEFVO15553 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MEFVO15553 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MEFVO15553 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MEFVO15553 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MEFVO15553 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MEFVO15553 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MEFVO15553 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MEFVO15553 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MEFVO15553 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MEFVO15553 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MEFVO15553 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MEFVO15553 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MEFVO15553 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MEFVO15553 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MEFVO15553 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MEFVO15553 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MEFVO15553 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MEFVO15553 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MEFVO15553 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MEFVO15553 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MEFVO15553 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MEFVO15553 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MEFVO15553 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MEFVO15553 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MEFVO15553 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MEFVO15553 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MEFVO15553 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MEFVO15553 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MEFVO15553 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MEFVO15553 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MEFVO15553 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MEFVO15553 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MEFVO15553 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MEFVO15553 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MEFVO15553 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
MEFVO15553 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
MEFVO15553 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
MEFVO15553 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MEFVO15553 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
MEFVO15553 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MEFVO15553 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MEFVO15553 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MEFVO15553 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MEFVO15553 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MEFVO15553 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MEFVO15553 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MEFVO15553 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MEFVO15553 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MEFVO15553 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MEFVO15553 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MEFVO15553 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MEFVO15553 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MEFVO15553 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MEFVO15553 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MEFVO15553 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MEFVO15553 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MEFVO15553 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MEFVO15553 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MEFVO15553 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MEFVO15553 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MEFVO15553 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MEFVO15553 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MEFVO15553 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MEFVO15553 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MEFVO15553 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MEFVO15553 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MEFVO15553 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MEFVO15553 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MEFVO15553 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MEFVO15553 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MEFVO15553 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MEFVO15553 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MEFVO15553 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MEFVO15553 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MEFVO15553 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MEFVO15553 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MEFVO15553 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MEFVO15553 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MEFVO15553 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MEFVO15553 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MEFVO15553 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MEFVO15553 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MEFVO15553 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MEFVO15553 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MEFVO15553 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MEFVO15553 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MEFVO15553 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms