Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SYNMO15061 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYNMO15061 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SYNMO15061 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYNMO15061 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYNMO15061 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYNMO15061 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYNMO15061 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYNMO15061 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYNMO15061 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYNMO15061 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYNMO15061 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYNMO15061 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYNMO15061 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYNMO15061 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYNMO15061 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYNMO15061 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYNMO15061 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYNMO15061 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYNMO15061 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYNMO15061 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYNMO15061 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SYNMO15061 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYNMO15061 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYNMO15061 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYNMO15061 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYNMO15061 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYNMO15061 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYNMO15061 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYNMO15061 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYNMO15061 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYNMO15061 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SYNMO15061 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SYNMO15061 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SYNMO15061 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYNMO15061 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYNMO15061 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SYNMO15061 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYNMO15061 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYNMO15061 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYNMO15061 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYNMO15061 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYNMO15061 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYNMO15061 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNMO15061 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNMO15061 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNMO15061 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNMO15061 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNMO15061 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNMO15061 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNMO15061 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNMO15061 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNMO15061 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNMO15061 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNMO15061 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNMO15061 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNMO15061 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNMO15061 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNMO15061 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNMO15061 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNMO15061 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNMO15061 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYNMO15061 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYNMO15061 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYNMO15061 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYNMO15061 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYNMO15061 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYNMO15061 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYNMO15061 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYNMO15061 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYNMO15061 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYNMO15061 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SYNMO15061 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYNMO15061 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYNMO15061 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYNMO15061 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYNMO15061 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYNMO15061 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYNMO15061 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYNMO15061 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYNMO15061 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYNMO15061 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SYNMO15061 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SYNMO15061 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SYNMO15061 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SYNMO15061 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SYNMO15061 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNMO15061 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNMO15061 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNMO15061 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNMO15061 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNMO15061 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNMO15061 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNMO15061 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNMO15061 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNMO15061 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNMO15061 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNMO15061 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNMO15061 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYNMO15061 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms