Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F3O00716 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F3O00716 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F3O00716 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F3O00716 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F3O00716 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F3O00716 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F3O00716 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F3O00716 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F3O00716 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F3O00716 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F3O00716 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F3O00716 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F3O00716 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F3O00716 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F3O00716 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F3O00716 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F3O00716 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F3O00716 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F3O00716 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F3O00716 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F3O00716 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F3O00716 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F3O00716 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F3O00716 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F3O00716 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F3O00716 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F3O00716 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F3O00716 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F3O00716 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F3O00716 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F3O00716 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F3O00716 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F3O00716 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F3O00716 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F3O00716 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F3O00716 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F3O00716 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F3O00716 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F3O00716 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F3O00716 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F3O00716 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F3O00716 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F3O00716 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F3O00716 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F3O00716 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F3O00716 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F3O00716 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F3O00716 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F3O00716 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F3O00716 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F3O00716 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F3O00716 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F3O00716 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F3O00716 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F3O00716 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F3O00716 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F3O00716 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F3O00716 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F3O00716 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F3O00716 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F3O00716 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F3O00716 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F3O00716 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F3O00716 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F3O00716 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F3O00716 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F3O00716 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F3O00716 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F3O00716 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F3O00716 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F3O00716 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F3O00716 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F3O00716 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F3O00716 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F3O00716 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F3O00716 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F3O00716 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F3O00716 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F3O00716 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F3O00716 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F3O00716 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F3O00716 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F3O00716 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F3O00716 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F3O00716 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F3O00716 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F3O00716 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F3O00716 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F3O00716 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F3O00716 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F3O00716 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F3O00716 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F3O00716 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F3O00716 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F3O00716 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F3O00716 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F3O00716 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F3O00716 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
E2F3O00716 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms