Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC01387J3KSC0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms