Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E9PMD0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E9PMD0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E9PMD0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E9PMD0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E9PMD0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E9PMD0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E9PMD0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E9PMD0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E9PMD0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E9PMD0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E9PMD0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E9PMD0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
E9PMD0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E9PMD0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E9PMD0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E9PMD0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
E9PMD0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E9PMD0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E9PMD0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E9PMD0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E9PMD0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E9PMD0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E9PMD0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E9PMD0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E9PMD0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E9PMD0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E9PMD0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E9PMD0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E9PMD0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E9PMD0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E9PMD0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E9PMD0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E9PMD0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E9PMD0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E9PMD0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E9PMD0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E9PMD0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E9PMD0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E9PMD0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E9PMD0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E9PMD0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
E9PMD0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
E9PMD0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
E9PMD0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
E9PMD0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
E9PMD0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
E9PMD0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
E9PMD0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
E9PMD0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
E9PMD0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
E9PMD0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
E9PMD0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
E9PMD0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
E9PMD0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
E9PMD0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E9PMD0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E9PMD0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E9PMD0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E9PMD0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E9PMD0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E9PMD0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E9PMD0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E9PMD0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E9PMD0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E9PMD0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E9PMD0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E9PMD0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E9PMD0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E9PMD0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E9PMD0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E9PMD0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E9PMD0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E9PMD0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E9PMD0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
E9PMD0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E9PMD0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
E9PMD0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E9PMD0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E9PMD0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E9PMD0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E9PMD0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E9PMD0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E9PMD0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E9PMD0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E9PMD0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E9PMD0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E9PMD0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E9PMD0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E9PMD0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E9PMD0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E9PMD0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E9PMD0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E9PMD0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E9PMD0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E9PMD0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E9PMD0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E9PMD0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E9PMD0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PMD0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms