Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L12C9JPN9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
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