Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DXG7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DXG7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DXG7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DXG7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DXG7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DXG7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DXG7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DXG7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DXG7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DXG7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DXG7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DXG7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DXG7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DXG7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
B4DXG7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DXG7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DXG7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DXG7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DXG7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DXG7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DXG7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DXG7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DXG7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DXG7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DXG7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DXG7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DXG7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DXG7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DXG7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DXG7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DXG7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DXG7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DXG7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DXG7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DXG7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DXG7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DXG7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DXG7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DXG7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DXG7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DXG7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DXG7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DXG7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DXG7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DXG7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DXG7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DXG7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
B4DXG7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DXG7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DXG7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DXG7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DXG7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DXG7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DXG7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DXG7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DXG7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DXG7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DXG7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DXG7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DXG7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DXG7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DXG7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DXG7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DXG7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DXG7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DXG7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DXG7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DXG7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DXG7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DXG7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DXG7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DXG7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DXG7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DXG7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DXG7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B4DXG7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
B4DXG7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
B4DXG7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
B4DXG7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
B4DXG7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
B4DXG7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
B4DXG7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
B4DXG7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
B4DXG7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
B4DXG7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
B4DXG7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
B4DXG7 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
B4DXG7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
B4DXG7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
B4DXG7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
B4DXG7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
B4DXG7 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
B4DXG7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
B4DXG7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
B4DXG7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
B4DXG7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
B4DXG7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
B4DXG7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
B4DXG7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.2 ms