Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF879B4DU55 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms