Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HMGB1P1B2RPK0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms