Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HACD1B0YJ81 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HACD1B0YJ81 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HACD1B0YJ81 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HACD1B0YJ81 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HACD1B0YJ81 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HACD1B0YJ81 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HACD1B0YJ81 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HACD1B0YJ81 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HACD1B0YJ81 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HACD1B0YJ81 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms