Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SOBPA7XYQ1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SOBPA7XYQ1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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