Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC85CA6NKD9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC85CA6NKD9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC85CA6NKD9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC85CA6NKD9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC85CA6NKD9 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC85CA6NKD9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC85CA6NKD9 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC85CA6NKD9 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC85CA6NKD9 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC85CA6NKD9 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC85CA6NKD9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC85CA6NKD9 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC85CA6NKD9 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC85CA6NKD9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC85CA6NKD9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC85CA6NKD9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC85CA6NKD9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC85CA6NKD9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC85CA6NKD9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC85CA6NKD9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC85CA6NKD9 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC85CA6NKD9 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC85CA6NKD9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC85CA6NKD9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC85CA6NKD9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC85CA6NKD9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC85CA6NKD9 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC85CA6NKD9 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC85CA6NKD9 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC85CA6NKD9 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC85CA6NKD9 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC85CA6NKD9 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC85CA6NKD9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC85CA6NKD9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC85CA6NKD9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC85CA6NKD9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC85CA6NKD9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC85CA6NKD9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC85CA6NKD9 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC85CA6NKD9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC85CA6NKD9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC85CA6NKD9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC85CA6NKD9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC85CA6NKD9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC85CA6NKD9 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms