Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LIPT2A6NK58 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms