Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC160A6NGH7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms