Protein–RNA interactions for Protein: A6NEY3

GOLGA6L3, Putative golgin subfamily A member 6-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L3A6NEY3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA6L3A6NEY3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GOLGA6L3A6NEY3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
GOLGA6L3A6NEY3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GOLGA6L3A6NEY3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L3A6NEY3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L3A6NEY3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L3A6NEY3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L3A6NEY3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L3A6NEY3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L3A6NEY3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L3A6NEY3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L3A6NEY3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L3A6NEY3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L3A6NEY3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L3A6NEY3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA6L3A6NEY3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms