Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L4A6NCW7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms