Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 UBE2F-204ENST00000409953 924 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC004012.1-201ENST00000416593 534 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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SH3BP4Q9P0V3 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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SH3BP4Q9P0V3 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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SH3BP4Q9P0V3 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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SH3BP4Q9P0V3 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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SH3BP4Q9P0V3 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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SH3BP4Q9P0V3 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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SH3BP4Q9P0V3 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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SH3BP4Q9P0V3 NR1I3-229ENST00000511748 480 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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SH3BP4Q9P0V3 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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SH3BP4Q9P0V3 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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SH3BP4Q9P0V3 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 OR14A16-202ENST00000641093 1367 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SH3BP4Q9P0V3 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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