Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC099796.1-201ENST00000433377 683 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AL121917.1-201ENST00000441270 893 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 PLEKHA3P1-201ENST00000598554 894 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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