Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AC078923.1-202ENST00000552466 712 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 AC048337.1-201ENST00000557474 552 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 AC009108.2-201ENST00000566485 269 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 SHBG-218ENST00000576728 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 RN7SL192P-201ENST00000584303 299 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 PHBP20-201ENST00000603694 818 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 AC092175.1-201ENST00000605325 200 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 FAM197Y4-201ENST00000616275 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 AC138894.4-201ENST00000616703 256 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 FAM197Y5-203ENST00000619815 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 ENTPD1-203ENST00000371207 1903 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 C1orf220-202ENST00000521244 2577 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 LPXN-201ENST00000395074 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 SIM1-201ENST00000262901 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 LY9-201ENST00000263285 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 SLC8A1-202ENST00000402441 3065 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 LINC01484-203ENST00000521128 2361 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 HIVEP2-201ENST00000012134 9755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 UTY-201ENST00000329134 4325 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 CDK15-201ENST00000260967 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 ZNF10-203ENST00000426665 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 FZD10-AS1-201ENST00000505807 10193 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 ZNF385B-203ENST00000409692 2109 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 LINC00960-202ENST00000492922 2126 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 CALCOCO1-210ENST00000548263 3888 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 ZNF207-202ENST00000342555 1905 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 ACSBG2-206ENST00000588485 2478 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 KIF24-201ENST00000379174 5729 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 ABI1-208ENST00000376160 3515 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 CLNK-201ENST00000226951 5599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 GSTZ1-203ENST00000361389 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 RNA5SP379-201ENST00000364599 113 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 BPIFA3-202ENST00000375454 1116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 CST13P-201ENST00000376992 428 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 RFFL-203ENST00000413582 1217 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 AC007384.1-202ENST00000417026 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 AC009299.1-201ENST00000429684 717 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 AC074257.1-201ENST00000446340 585 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 PRDX2P1-201ENST00000450181 589 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 GAPDHP50-201ENST00000464421 993 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 RPPH1-3P-201ENST00000516541 322 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 AC073176.1-201ENST00000560700 534 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 IGHV3OR16-15-201ENST00000565463 414 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 GOLGA6L17P-201ENST00000611297 586 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 GRB10-203ENST00000398810 4785 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 ADD2-201ENST00000264436 9267 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 TECTB-201ENST00000369422 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 CYP4A22-201ENST00000294337 1725 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 EIF5A2-201ENST00000295822 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 ANKRD20A21P-202ENST00000623715 3588 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 AC025031.5-201ENST00000623851 2523 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 SNX19P2-201ENST00000452841 2971 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 NUMA1-201ENST00000351960 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 SEC31B-201ENST00000370345 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 EXOSC2-211ENST00000546165 1956 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 FIGNL1-206ENST00000433017 3626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 SEC23IP-208ENST00000543134 1461 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 RBMS2-204ENST00000550726 1452 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 AF228730.7-203ENST00000641436 1804 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 GBP2-201ENST00000370466 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 AGPAT4-201ENST00000320285 7865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 RUBCN-201ENST00000273582 6955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 LRRC37A4P-202ENST00000581296 5372 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 NHS-204ENST00000615422 8860 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 SSR3-201ENST00000265044 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 AC240565.2-201ENST00000623180 2096 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 SIM1-202ENST00000369208 8430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 ABCE1-201ENST00000296577 3921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 KCNE1-206ENST00000432085 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 TMPRSS4-220ENST00000618855 3531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 PIEZO2-210ENST00000580640 8334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 CRIP3-201ENST00000274990 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 C22orf15-202ENST00000382821 646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 SPAG11B-205ENST00000398462 655 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 AL121910.1-201ENST00000420710 500 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 RPL29P28-201ENST00000421928 472 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 GSTA6P-201ENST00000424144 582 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 AC010148.1-201ENST00000427619 707 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CACNB1Q02641 AC064862.2-201ENST00000445460 196 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms