Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
E2F1Q01094 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
E2F1Q01094 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.9 ms