Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 NF1P12-201ENST00000549593 583 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 CDRT8-201ENST00000579752 467 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 RN7SL473P-201ENST00000580341 299 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC011193.2-201ENST00000582638 367 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AL589765.5-201ENST00000596133 515 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC005609.2-201ENST00000623320 592 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC010653.3-201ENST00000635332 232 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC023818.2-201ENST00000623817 2304 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 NUMB-223ENST00000556772 5172 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 FBXL4-202ENST00000369244 8035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 KIF6-202ENST00000287152 9082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 ZC3H6-202ENST00000409871 11542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 CYP27C1-201ENST00000335247 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 SPA17-204ENST00000532692 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 ZNF595-204ENST00000609518 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 MORC1-202ENST00000483760 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC245505.2-201ENST00000553572 3055 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 LINC01060-204ENST00000510832 2435 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC061975.5-201ENST00000584928 1441 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 RBFOX2-207ENST00000414461 1706 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 ZNF69-202ENST00000429654 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 RTL3-201ENST00000321110 2648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 PDE4DIP-203ENST00000369349 4677 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 KRIT1-203ENST00000394505 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 LINC02128-205ENST00000641755 1334 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 CCDC30-202ENST00000342022 3098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 CCDC66-203ENST00000394672 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 IL18RAP-202ENST00000409369 1890 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AL136298.2-201ENST00000556497 1570 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 NPPA-AS1-201ENST00000400892 936 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 YWHAZP3-201ENST00000415292 738 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 FDPSP1-201ENST00000424976 1071 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC104463.2-201ENST00000428573 314 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 FECHP1-201ENST00000431896 1214 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC123904.1-201ENST00000441072 368 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 LINC00533-201ENST00000456103 537 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC044784.1-201ENST00000456526 677 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 RN7SL388P-201ENST00000498736 339 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 SSU72P6-201ENST00000532644 488 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC013356.3-201ENST00000558601 584 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 RPS11-203ENST00000596873 583 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC023513.1-201ENST00000604396 691 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC012640.3-201ENST00000607847 430 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AL137000.1-201ENST00000610528 1244 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 BRD8-202ENST00000254900 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 C14orf166-201ENST00000261700 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 TCF4-246ENST00000570287 3163 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 ZNF845-202ENST00000595091 4413 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 SNX16-202ENST00000353788 3032 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 MFSD8-227ENST00000641393 4069 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 TRIM66-202ENST00000402157 10086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
PTPREP23469 ZNF226-213ENST00000588883 5972 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 PTBP3-204ENST00000374255 3413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 NFAT5-208ENST00000566899 4914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 PRICKLE2-201ENST00000295902 7918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 ZNF91-202ENST00000397082 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AL031123.3-201ENST00000623345 1837 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 SLC7A2-203ENST00000470360 7638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 THAP12P7-201ENST00000520248 2290 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 SYT1-212ENST00000552744 2718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 USP47-203ENST00000399455 7396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 MUM1L1-201ENST00000337685 4308 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 MIR138-2-201ENST00000384916 84 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 RNA5SP23-201ENST00000391006 105 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
PTPREP23469 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms