Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 HMGCR-209ENST00000511206 3395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 OLFM3-202ENST00000370103 3255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 AC087477.2-202ENST00000558499 4856 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 TRPM3-212ENST00000396283 3484 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 CEP250-202ENST00000397527 15703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 AC011462.3-201ENST00000598988 540 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 PTPRG-AS1-204ENST00000474795 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 ZNF790-206ENST00000613249 2183 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 COX7B-203ENST00000481445 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 SYNPO2-202ENST00000429713 9920 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ZNRF3Q9ULT6 AC091390.2-201ENST00000432573 374 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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