Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 RGS5-215ENST00000439699 1441 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 AL450426.1-201ENST00000635678 1602 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC0.96□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 RIF1-205ENST00000444746 7897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 TTC39B-208ENST00000512701 10483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGAP28-201ENST00000262227 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC0.96□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 MTA3-201ENST00000405094 1785 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 AC095038.1-201ENST00000429248 1591 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 SMARCA2-252ENST00000636559 6853 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 ATF7IP-222ENST00000544627 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
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KRTAP21-1Q3LI58 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
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KRTAP21-1Q3LI58 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 Z96074.1-203ENST00000637685 1746 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 SP4-201ENST00000222584 6126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
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KRTAP21-1Q3LI58 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
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KRTAP21-1Q3LI58 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 RIF1-201ENST00000243326 15003 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
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KRTAP21-1Q3LI58 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
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KRTAP21-1Q3LI58 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
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KRTAP21-1Q3LI58 CTNND1-230ENST00000532245 5655 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 OR52K1-202ENST00000641528 5456 ntAPPRIS P1 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 KIAA1524-207ENST00000619684 2839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 CENPN-205ENST00000439957 1699 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 AC096992.2-201ENST00000609553 1684 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 AC129502.1-201ENST00000623261 1654 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 GREM1-203ENST00000622074 14606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
KRTAP21-1Q3LI58 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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