Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 CASC15-201ENST00000444265 1497 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SP140Q13342 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AL034417.1-201ENST00000399343 800 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 RPS7P10-201ENST00000464254 603 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 VEPH1-219ENST00000537559 992 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 LIPF-205ENST00000608620 1290 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SP140Q13342 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SP140Q13342 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
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