Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 AC003087.1-201ENST00000412828 499 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 FNDC3B-205ENST00000423424 408 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 RPL31P11-202ENST00000454082 372 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 AL034374.2-201ENST00000605281 548 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 STARD13-AS-224ENST00000608496 787 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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C9orf16Q9BUW7 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 FCRL2-205ENST00000469986 902 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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C9orf16Q9BUW7 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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C9orf16Q9BUW7 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
C9orf16Q9BUW7 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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