Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 AC011611.6-201ENST00000547483 255 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 CR382285.1-202ENST00000604687 547 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 BX005040.2-201ENST00000620504 370 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 MAPK10-251ENST00000640858 3052 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 CASC23-201ENST00000534076 1563 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 CENPN-205ENST00000439957 1699 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 ELOVL5-201ENST00000304434 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 ACSL4-204ENST00000469796 5225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 OSBPL1A-202ENST00000357041 1869 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 INTS7-204ENST00000440600 3136 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 SMG1-210ENST00000565224 2372 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 HMGCR-209ENST00000511206 3395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 GSTM2-207ENST00000460717 1449 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 SMAD5-AS1-201ENST00000297163 1816 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 C8orf34-208ENST00000523686 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 IL31RA-207ENST00000490985 2414 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
SCG3Q8WXD2 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 YES1-201ENST00000314574 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 NRCAM-204ENST00000379028 6685 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 BDNF-209ENST00000420794 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 MITF-206ENST00000394351 1956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC007731.1-202ENST00000610338 1870 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 CWC15-201ENST00000279839 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 ZNF160-208ENST00000599056 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 BROX-209ENST00000612948 4028 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 ADK-201ENST00000286621 1169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 FCHSD2-202ENST00000409263 932 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 SNX18P13-201ENST00000412442 529 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AL109924.2-201ENST00000419800 934 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 SNX18P3-201ENST00000424993 835 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 LINC00578-202ENST00000442937 612 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 MIR4422HG-201ENST00000451250 638 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 RN7SL180P-201ENST00000466769 294 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC083843.1-201ENST00000521444 849 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC055860.1-201ENST00000525523 688 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC127526.3-201ENST00000534291 450 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 ORMDL2-203ENST00000548974 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC013283.1-201ENST00000557282 492 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 MED31-202ENST00000574128 619 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AL022238.3-201ENST00000609279 443 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 XPNPEP3-206ENST00000614001 230 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 MIAT_exon1.1-201ENST00000617016 135 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 NAALAD2-201ENST00000321955 3035 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 RAB2B-201ENST00000397762 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 CYP2C18-201ENST00000285979 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 CLEC7A-205ENST00000353231 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 FOLH1B-202ENST00000529567 2145 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 NPIPB9-202ENST00000550983 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
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