Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 LRRTM3-201ENST00000361320 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 F5-201ENST00000367796 7039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 F5-202ENST00000367797 7024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 Z98949.3-201ENST00000436423 472 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC095057.1-201ENST00000507583 168 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC116631.1-202ENST00000640984 683 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 ERG-205ENST00000398910 4954 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 NFX1-203ENST00000379540 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 CACNB4-239ENST00000636947 5575 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 LIN28B-201ENST00000345080 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 INTS2-201ENST00000251334 4255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 SHPRH-206ENST00000438092 6994 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 LINC00506-203ENST00000629295 4300 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 ADGRG6-201ENST00000230173 7026 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 HMBOX1-211ENST00000524238 1731 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 ATP2B1-204ENST00000428670 7032 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 UBE2V1-201ENST00000340309 2536 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 ZFHX3-203ENST00000397992 13841 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 KIDINS220-201ENST00000256707 7361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 FAT1-201ENST00000441802 14786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 SCAPER-202ENST00000324767 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 GPR107-202ENST00000372406 7353 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 WDR19-201ENST00000399820 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 CARF-202ENST00000402905 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 SEC23IP-201ENST00000369075 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
HERC1Q15751 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
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