Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms