Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
CUL4AQ13619 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CUL4AQ13619 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
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