Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 MYOCD-203ENST00000425538 8466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 NSRP1-217ENST00000612959 2420 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 AC117382.2-201ENST00000564748 3151 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 MAML2-202ENST00000618849 3154 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 PRDX6-201ENST00000340385 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 ADGRE1-201ENST00000250572 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 BTN2A1-201ENST00000312541 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 CASC19-205ENST00000641013 1411 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
CLN3Q13286 HNRNPR-210ENST00000478691 7646 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 EPHB2-201ENST00000374627 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AL133464.1-201ENST00000635130 1705 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 MYB-235ENST00000533624 1818 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 MYB-238ENST00000534044 1812 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 BDNF-AS-201ENST00000499008 2324 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 TRIM42-201ENST00000286349 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 UTY-202ENST00000331397 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 GABRP-201ENST00000265294 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 ZNF544-201ENST00000269829 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 ARMCX7P-201ENST00000372828 562 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 RNU1-11P-201ENST00000383975 164 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 SLC2A11-205ENST00000403208 564 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC127537.1-201ENST00000418183 748 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC108868.2-201ENST00000451464 511 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC092570.2-201ENST00000452117 1143 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 CBX5P1-201ENST00000468470 561 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 LINC01182-201ENST00000503532 582 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 LINC01608-202ENST00000524283 561 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 HHLA3-207ENST00000531950 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC115676.1-201ENST00000538416 329 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 MUCL1-202ENST00000546809 439 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AL133304.1-201ENST00000548199 549 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 FDPSP3-201ENST00000556903 1013 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 ZNF415-218ENST00000599261 601 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC005303.1-201ENST00000607906 740 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 MIAT_exon5_1.1-201ENST00000618919 149 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 LAMP2-202ENST00000371335 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 TP63-201ENST00000264731 4909 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 ZNF793-201ENST00000445217 6712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 CCDC39-201ENST00000442201 3279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 FBXO40-201ENST00000338040 5929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 CCDC125-203ENST00000396499 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 SAR1A-202ENST00000373238 3227 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 SERPINB13-202ENST00000344731 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 TTC33-201ENST00000337702 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 HYAL4-201ENST00000223026 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 CDH17-202ENST00000441892 2204 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AL136140.2-201ENST00000624717 1705 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 CCNT2-202ENST00000295238 4491 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 ERGIC1-201ENST00000326654 3952 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 SELENOT-202ENST00000471696 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AL136981.1-203ENST00000451452 3844 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 ZNF136-201ENST00000343979 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 RNF219-201ENST00000282003 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 BBS12-203ENST00000542236 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AL031123.2-201ENST00000563225 3325 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 ZNF234-201ENST00000426739 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 ZNF680-201ENST00000309683 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 OR51E1-202ENST00000530215 2942 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 WDR89-204ENST00000620954 2935 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC011632.1-202ENST00000518128 2810 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 BMX-202ENST00000348343 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 DDX50P1-201ENST00000438163 2400 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 SIPA1L1-202ENST00000381232 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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