Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PTP4A2Q12974 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms