Protein–RNA interactions for Protein: Q12955

ANK3, Ankyrin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANK3Q12955 HEPH-202ENST00000343002 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 LIMCH1-202ENST00000381753 5705 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 PTPRT-204ENST00000373190 12559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 HIVEP3-202ENST00000372584 12319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 VWA5A-205ENST00000456829 4388 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 EIF4E3-204ENST00000425534 9949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 AGAP1-212ENST00000614409 9932 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 PBRM1-206ENST00000409114 5015 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 ROBO2-202ENST00000461745 8946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 ZNF423-203ENST00000561648 7907 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 NSD2-208ENST00000420906 5109 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 TBC1D16-201ENST00000310924 10936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 DICER1-204ENST00000527414 6179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 LINC02217-201ENST00000505844 687 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 ERCC6-201ENST00000355832 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 OR5H1-202ENST00000641874 5999 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 SPTAN1-223ENST00000630866 7498 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 PLXNA2-201ENST00000367033 11444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 ZNF226-213ENST00000588883 5972 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 AFAP1-AS1-201ENST00000608442 6795 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 ADAM22-205ENST00000398209 9144 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 AP001043.1-202ENST00000380931 5027 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 ZNF407-202ENST00000309902 5595 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 AL139231.1-201ENST00000431001 312 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANK3Q12955 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms