Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 WDPCP-204ENST00000409199 2466 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 EIF1-203ENST00000469257 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 LPAL2-203ENST00000454031 2498 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 GPR1-AS-201ENST00000623040 3708 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 AC010132.4-201ENST00000569883 1368 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 PTPRR-202ENST00000342084 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 AC006305.1-201ENST00000382897 2558 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 CFAP61-210ENST00000451767 1946 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPCL4-201ENST00000323770 882 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 CSN2-201ENST00000353151 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 ZNF37CP-201ENST00000406795 241 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP225-201ENST00000410405 352 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 RPL35P8-201ENST00000433284 337 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 AL357552.2-201ENST00000433876 353 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 MIR4435-2HG-211ENST00000443467 826 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 DEFA11P-201ENST00000446470 261 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 IGKV1OR2-2-201ENST00000451163 355 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 RPS29P5-201ENST00000452777 171 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 CEACAMP3-202ENST00000483806 638 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 NPY6R-201ENST00000503807 1112 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 LINC01085-203ENST00000511195 326 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 IGLV10-67-201ENST00000519446 325 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 AC084026.2-201ENST00000521101 642 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 AC090692.1-201ENST00000531569 541 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 AP003721.1-201ENST00000543907 864 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 AL049780.1-201ENST00000554430 489 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 AC108861.1-201ENST00000611634 585 ntTSL 4 BASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 MIR548A1HG-202ENST00000637804 784 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 AC017000.1-201ENST00000639380 578 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 ACAA2-206ENST00000589432 1840 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 NAALAD2-201ENST00000321955 3035 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 ZNF770-201ENST00000356321 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 AL133320.1-201ENST00000621423 2352 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CSPP1Q1MSJ5 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 ATP5BP1-201ENST00000411980 1574 ntBASIC8.65□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 ACSL4-204ENST00000469796 5225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 ZG16-201ENST00000400752 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 CDC42-201ENST00000315554 1452 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 SULT1C2-202ENST00000326853 2828 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 RSC1A1-201ENST00000345034 1854 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 CRBN-201ENST00000231948 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 ARL4A-201ENST00000356797 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP63-201ENST00000363187 301 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms