Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 AL133243.4-201ENST00000623116 3109 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 FGF10-201ENST00000264664 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 ZNF549-204ENST00000602149 5505 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 GJC1-202ENST00000426548 7640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 EEF1A1P28-201ENST00000450915 1403 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AMELY-201ENST00000215479 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 SPATA19-201ENST00000299140 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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PHACTR1Q9C0D0 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AL365295.1-204ENST00000425648 553 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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PHACTR1Q9C0D0 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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PHACTR1Q9C0D0 HMGN1P32-201ENST00000441744 256 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC005515.1-201ENST00000456368 289 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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PHACTR1Q9C0D0 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL241P-201ENST00000482973 236 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
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PHACTR1Q9C0D0 HNRNPC-226ENST00000556628 1156 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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PHACTR1Q9C0D0 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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PHACTR1Q9C0D0 HABP2-201ENST00000351270 3009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 ZNF566-201ENST00000392170 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
PHACTR1Q9C0D0 MGAM-209ENST00000620571 6483 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 TMC5-208ENST00000564959 2434 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 C2orf80-201ENST00000341287 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 RN7SKP232-201ENST00000410170 290 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 AL590730.1-202ENST00000418875 321 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PHACTR1Q9C0D0 EFCAB14P1-201ENST00000442409 463 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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