Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC8□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC8□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC8□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC8□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC8□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC8□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC8□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC8□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC8□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC8□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC8□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC8□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 ZNF407-203ENST00000577538 5794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 ALS2-201ENST00000264276 6644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 FAM186A-201ENST00000327337 7127 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 TIAM2-208ENST00000461783 6981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 USP29-201ENST00000254181 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 SLC4A10-201ENST00000272716 3414 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 MAPK10-371ENST00000641952 5209 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 BTBD10-210ENST00000530907 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 SLC23A2-202ENST00000379333 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 MYO1B-203ENST00000392316 4764 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 RBFOX2-205ENST00000405409 6932 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC7.97□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 ZNF286A-202ENST00000395894 5443 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
RNF17Q9BXT8 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.1 ms