Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TRAPPC9Q96Q05 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms