Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 C11orf1-203ENST00000529270 1437 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 TCF12-205ENST00000537840 1598 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 TMEM31-201ENST00000319560 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 HMGN1P17-201ENST00000513734 295 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 TPT1-AS1-209ENST00000520585 818 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AP001000.1-201ENST00000526843 742 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
IFT88Q13099 DYNC2LI1-210ENST00000605786 1346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 C2orf88-202ENST00000396974 998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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