Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 CLUHP10-201ENST00000631979 980 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 RSPO3-202ENST00000368317 1290 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 IGKV6D-41-201ENST00000390271 371 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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CASQ1P31415 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 LINC00354-201ENST00000412119 347 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 AC016745.1-201ENST00000422178 508 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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CASQ1P31415 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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CASQ1P31415 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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CASQ1P31415 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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CASQ1P31415 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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CASQ1P31415 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 LINC01396-201ENST00000609099 527 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 Metazoa_SRP.195-201ENST00000612667 287 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CASQ1P31415 MIR6726-201ENST00000613751 61 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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