Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC099654.11-201ENST00000638857 294 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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SYCP1Q15431 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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SYCP1Q15431 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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SYCP1Q15431 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SYCP1Q15431 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
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SYCP1Q15431 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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SYCP1Q15431 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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SYCP1Q15431 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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SYCP1Q15431 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 OR51B4-201ENST00000380224 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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SYCP1Q15431 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC009879.1-201ENST00000520029 839 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 PSMA4-209ENST00000559082 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC023906.3-201ENST00000559825 874 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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