Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
ATP1A4Q13733 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC005393.1-201ENST00000617916 584 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ATP1A4Q13733 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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