Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 NUDT5-203ENST00000378940 1126 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 AC245036.1-201ENST00000391727 309 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 RN7SKP221-201ENST00000410420 301 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 SMARCE1P1-201ENST00000417747 1186 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 AC063943.2-201ENST00000495697 534 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 H3F3AP3-201ENST00000497682 407 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 BTG1P1-201ENST00000540396 508 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 AL096869.1-201ENST00000557622 559 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 CCR6-202ENST00000349984 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 OR2T33-202ENST00000641220 4118 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 DIAPH3-206ENST00000465066 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 LINC01205-201ENST00000489670 1331 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 ZNF484-204ENST00000395506 4031 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 GTF2E1-201ENST00000283875 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 ARPP21-220ENST00000441454 2880 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
AP3B2Q13367 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms